Un Biodigestor está basado en un sistema de fermentación natural que ocurre en ausencia de oxigeno (sin aire) que facilita el crecimiento y proliferación de un grupo de bacterias anaerobias/metanogénicas, que descomponen y tratan los residuos dejando como resultado final un gas combustible conocido como biogas o gas metano (CH4) y dióxido de carbono (CO2) además de un efluente líquido rico en nutrientes y materia orgánica estabilizada.