Se debe seguir un minucioso procedimiento de diseño para que el pozo funcione de manera adecuada, en el que se considere, entre otros factores, un análisis de factibilidad, estudio geológico, recopilación de antecedentes, adecuada selección de materiales, así como el dimensionamiento de todos los elementos (perforación, ademe, contrademe, filtro, tanque de tormentas).

El diseño de un pozo de absorción depende del tamaño y forma del área disponible, las propiedades de infiltración y de la topografía del terreno.